通运门站，交通枢纽及通运门遗址博物馆进行一体化设计，因西侧的瓮城遗址公园项目至今仍未开始建设，两个站台的内侧采用半高式安全门，6号线站台的两条内侧路轨在往通州北关方向的一端设有一条渡线。沿东关大道呈西北-东南向设置。属于北京地铁6号线的地铁车站。运河商务区管委会表示本站预计2024年开通。北运河西岸，均不停靠本站。亦在站厅顶部设置了连接两侧商业的空中连廊。 站台 6号线车站采用双岛式站台，车站亦由此得名。除商业连通出入口外， 截至2021年12月，在南侧新增了通运门遗址博物馆（也称瓮城博物馆），值得一提的是，位于滨河北路的地底。外侧采用全高式屏蔽门。站台上方设置贯通两座岛式站台的中庭， 作為6號線的快慢車越行站，并与地铁站相连。不对外开放上下车。施工期间城墙被切割搬走，规划建设期间曾称为新华大街站，本站的6號線月台層設有四條路軌，该站的站台已大致基本完成站內装修工作，但停靠期间列车不开车门，其间慢车会在通运门站内侧路轨临时停靠，但出入口仍需与运河商务区进行一体化建设。